11/23 質量分析関西談話会

第164回質量分析関西談話会に参加してきました。
http://www.mssj.jp/society/branch/kansai/kansai_danwa_164.html

今回のトピックは災害に強いマスづくりということで、昨今多発するの大型地震から、いかに質量分析装置を守るかという点を議論しました。

私たちのラボも昨年の大阪北部地震の被害を受け、質量分析装置の耐震を行った経験について発表しました。

まず背の高い装置(HPLC)は必ずラチェットベルトなどで倒れたり、各ユニットがばらばらにならないようにする必要があるようです。

さらに、装置を台にしっかり固定するのも重要です。各マスメーカーさんからも固定施工をおこなっているとのことですが、その方式は様々あるようでした。

質量分析装置を置くキャスター付きの台を床に固定するべきか、という点は議論が分かれました。キャスターを外しておいて装置自体が程よく揺れたほうが免振になる、装置の台が動き出してしまって人にとって危ない、などいろいろな意見が出ました。私たちのラボでは床にボルトを打って固定しています。

耐震にかけられる費用は限られているので、どのレベルの耐震をすれば、震度どれぐらいまで耐えられるのか、そのあたりを今後議論していく必要があるようです。

年明けはオミクスの社会実装に向けた話題が議論されるとのことで、興味のある方はぜひ。
http://www.mssj.jp/society/branch/kansai/kansai_danwa_165.html

11/20 バイオインフォマティクス相談部会第3回講演会

京都大学で開催された日本生物工学会バイオインフォマティクス相談部会の第3回講演会で岡橋が講演してきました。

https://www.sbj.or.jp/event/division_bioinfo_20191120.html

腸内細菌の網羅的脂質分析法についてご紹介しましたが、たくさん質問、コメントいただき、一層頑張らなければと思いました。

本講演会では、他にも質量分析データの解析法や大規模実験の自動化などのトピックが紹介され、とても勉強になりました。

11/3松田先生 Happy Birthday!

11月3日は松田先生の誕生日！

ということでラボの学生と岡橋先生で誕生日飲み会を開催しました。
(ひゃくばん 千里の台所　＠千里中央　https://r.gnavi.co.jp/k138900/)


最近寒くなってきたのでみんなでちゃんこ鍋を食べに行きました。

巨大な器にあふれるくらいの野菜とお肉が乗って運ばれてきて、さらに締めのうどんまであったのでとても満足しました。





食べ終わった後には、サプライズケーキで松田先生をお祝いしました。

松田先生はついにアラフィフに突入したらしいのですが、とてもエネルギッシュで肌もつやつやしています。

次は年末の忘年会があるのでそれまで皆さん頑張りましょう。

第13回メタボロームシンポジウム

毎年私たちのラボから参加しているメタボロームシンポジウムが筑波大学で行われ、松田教授が13C標識割合の新しい解釈法について、岡橋助教が呼吸鎖阻害時の代謝アダプテーション過程の網羅的計測について発表しました。

また同時に行われた若手会では津川先生による未知代謝物の同定法セミナーが行われ、参加者同士の交流も深めました。

次回は山形県鶴岡市の慶応先端研で行われるとのことで、来年度も楽しみです。

代謝マップ合宿

メタボローム解析を行った際、分析結果をパスウェイマップに載せてと可視化する作業は時間のかかる作業です。

簡単に代謝マップを作れたらいいなという要望に応えるために、バイオ情報計測学講座では先生学生みんなで代謝マップを作る合宿を行いました。

合宿ということで、みんなで中華の出前を取って気合を入れている図です。
夜は激辛鍋を食べて打ち上げをしました！

代謝マップの描画にはVANTEDという専用ソフトを使っています。
http://vanted.sourceforge.net/

これは白地図というデータの入っていない代謝マップを作成しておくと、
以後、専用のテンプレートにメタボロームデータを張り付けるだけで、
一瞬で代謝マップにデータを描画できるというソフトです。
こんな感じでエラーバーも付けられますし、設定すれば有意差検定も自動でできます。

現在私たちのラボで作った白地図はこちらで公開していますので、
興味のある方はぜひ使ってみてください。
https://github.com/fumiomatsuda/blankmaps

もし間違い等を見つけられた方は、ぜひ松田まで連絡お願いします。

9/16-18 日本生物工学会＠岡山

9/16-18は岡山大学津島キャンパスで行われた第71回日本生物工学会大会に参加しました。

私たちのラボからはＭ1の学生が4人参加し、口頭発表を行いました。

また、松田教授のランチョンセミナーは好評だったらしいです。見に行きたかった…

帰りは岡山を観光し、小豆島ラーメンを食べました。完

8/29-30 新学術 若手合宿

私たちの研究室は新学術領域代謝統合オミクスに参画しています。

http://transomics.umin.jp/index.html

8/29-30はこの領域の若手合宿に参加しました。

領域内のお互いの研究に理解を深め、コラボレーションを作っていこうという企画でした。

私たちのラボからM1,M2の学生さんたちがポスター発表に参加し、他分野の先生方とのディスカッションを通して、トランスオミクス手法の理解や自分の研究に足りない部分の認識につながったようです。

今後ますますの研究発展が期待できる若手合宿でした。