8/20-21 講座旅行@福井

今年の講座旅行は福井に行きました。

今回の目玉イベントはアスレチックです。
10mぐらいの高さにある足場やロープを命綱をつけてわたっていくやつです。
これスリルがあってめちゃくちゃおもしろいです！

晩御飯はBBQです。汗を流した後のごはんは格別でした。
助教の誕生日に学生のみなさんがサプライズケーキまで準備してくれました！
夜は遅くまで宴会で盛り上がりました。

翌日は福井の名所観光ということで東尋坊と恐竜博物館に行きました。
福井は自然が豊かで素晴らしいところだと実感できました。

 

普段はできない体験がたくさんできて、とても楽しい講座旅行でした。
幹事のみなさんありがとうございました。

バイオ計測サイエンス研究部会活動

日本プロテオーム学会/日本電気泳動学会合同大会2019＠宮崎において、日本生物工学会バイオ計測サイエンス研究部会のサテライトワークショップ行い、岡橋助教がフラックス解析のノウハウについて発表しました。

日本生物工学会のバイオ計測サイエンス研究部会では、年に数回、計測に関する様々なイベントを実施しています。

https://www.sbj.or.jp/division/division_bio_analysis.html

今回のサテライトシンポジウムでは、代謝フラックス解析の原理やノウハウ、注意点について解説しました。

今後もいろいろなイベントを実施していきますので、参加者大募集中です。

今回はプロテオーム学会ということで、大規模質量分析データを解析するショートコースにも参加し、方法論を学びました。

https://jpros2019.jpostdb.org/

これまで私たちのラボでは、MRMを用いたターゲットプロテオミクスで中心炭素代謝の酵素量を定量してきましたが、今後はノンターゲットプロテオミクスも積極的に実施していきます！

メロン 7/29

みんなでメロンを食べました。
めちゃくちゃ甘くておいしいメロンでした。
冷やしてはいけないらしいです。

院試激励会

新B4が配属されて3カ月がたち、院試勉強期間に入りました。
3カ月でみなさん興味深いデータを出してくれてました。

今日は院試に向けて激励飲み会を行いました。

自分が院試の時はオリンピックを見すぎて点が悪かったからしっかり勉強するように！という教授のありがたい話をみんなでありがたく聞く図です。

ワイワイしている学生さんの図です。

















B4のために凍った果実をすりつぶしてアイスを作る先輩メンズの図です。


ちなみに私たちの大学院の院試は、Essential細胞生物学からの筆記テスト、TOEIC、面接で行われます。
外部の人にもフェアな試験になっていますので、興味のある方はぜひご一報ください。

雑誌会 6/24

本日の雑誌会では、酵母細胞内のATP量イメージングに関する論文を勉強しました。
https://jcs.biologists.org/content/early/2019/03/06/jcs.230649

私共がふだん細胞内代謝物を測定する際は、細胞破砕、抽出などによって前処理し、質量分析法で計測しています。
この方法では試料を侵襲的に分析するため、代謝物の時間変化を捉えるには、複数の培養を並列して行う必要があり、とても大変です。
そのような難点を解決するため、本論文ではATP量に応じて蛍光が変化するセンサータンパクを酵母に発現し、ATP量の非侵襲リアルタイム計測を可能にしています。
酵母の出芽過程でATP量が一定に保たれているなど、ATP恒常性は生体にとって非常に重要であることを実感しました。
私共のラボでも共同研究で本ATPセンサーを導入し、他の計測法と組みあわせて代謝制御の理解に利用する取り組み始めています。
一緒に取り組んでくださるガッツのある方、大募集中です！

雑誌会 6/17

松田研では毎週、月曜日に進捗報告会と雑誌会をしています。
今日はグリセロールを基質として大腸菌で繊維原料のアセトールを生産する論文が紹介されました。
https://biotechnologyforbiofuels.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13068-019-1372-4
グリセロールはバイオディーゼルを作った際に余る副産物で、有効利用が求められています。
本論文では、アセトール生産性を向上させるために、13C代謝フラックス解析を使い、アセトール生産に必要なNADPHが不足していることを発見しました。
そこで、NADPH再生を強化した遺伝子改変大腸菌を作成し、アセトールの生産性を向上させることに成功しました。
13C代謝フラックス解析法が効果的に利用されており、非常に合理的なアプローチがとられている点が素晴らしい論文でした。

ASMS@アトランタ

6/2-6にアメリカのアトランタで行われたASMSで松田教授とD2の金澤さんが発表しました。
https://www.asms.org/conferences/annual-conference/annual-conference-homepage

ディープラーニングを使って大量の質量分析データを正確に自動処理する研究を発表する金澤さんです。